Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
USP36Q9P275 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP36Q9P275 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms