Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms