Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C9orf78Q9NZ63 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms