Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZDHHC3Q9NYG2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms