Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABCC13Q9NSE7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms