Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLHL4Q9C0H6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL4Q9C0H6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms