Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFIH1Q9BYX4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms