Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRIM54Q9BYV2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM54Q9BYV2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM54Q9BYV2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM54Q9BYV2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM54Q9BYV2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM54Q9BYV2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM54Q9BYV2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM54Q9BYV2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM54Q9BYV2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM54Q9BYV2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM54Q9BYV2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM54Q9BYV2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM54Q9BYV2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM54Q9BYV2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM54Q9BYV2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM54Q9BYV2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM54Q9BYV2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM54Q9BYV2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM54Q9BYV2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM54Q9BYV2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM54Q9BYV2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM54Q9BYV2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms