Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCMBPQ9BTE3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms