Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGIP1Q9BQI5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms