Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MEIS3Q99687 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms