Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPQ96QV1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HHIPQ96QV1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms