Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM20AQ96MK3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM20AQ96MK3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms