Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MALSU1Q96EH3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms