Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTSSAQ969W0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms