Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4DQ92854 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4DQ92854 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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