Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC148Q8NFR7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms