Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF182Q8N6D2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF182Q8N6D2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms