Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX90

SKA3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA3Q8IX90 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKA3Q8IX90 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms