Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Length 1,022 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC6Q8IVU3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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