Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A9Q8IVB4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A9Q8IVB4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A9Q8IVB4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A9Q8IVB4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A9Q8IVB4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A9Q8IVB4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A9Q8IVB4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A9Q8IVB4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A9Q8IVB4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A9Q8IVB4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A9Q8IVB4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A9Q8IVB4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A9Q8IVB4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A9Q8IVB4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A9Q8IVB4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A9Q8IVB4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A9Q8IVB4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A9Q8IVB4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A9Q8IVB4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms