Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TCF23Q7RTU1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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