Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC73Q6ZRK6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms