Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC36A4Q6YBV0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.4 ms