Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SHISA2Q6UWI4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SHISA2Q6UWI4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SHISA2Q6UWI4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SHISA2Q6UWI4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SHISA2Q6UWI4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHISA2Q6UWI4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHISA2Q6UWI4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHISA2Q6UWI4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHISA2Q6UWI4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHISA2Q6UWI4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SHISA2Q6UWI4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHISA2Q6UWI4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHISA2Q6UWI4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHISA2Q6UWI4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHISA2Q6UWI4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHISA2Q6UWI4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHISA2Q6UWI4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms