Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC102BQ68D86 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC102BQ68D86 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms