Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFGEF3Q5TH69 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms