Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LDLRAP1Q5SW96 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms