Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC178Q5BJE1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms