Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI3KQ59H18 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms