Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCBP3Q53F19 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NCBP3Q53F19 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NCBP3Q53F19 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCBP3Q53F19 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCBP3Q53F19 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCBP3Q53F19 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCBP3Q53F19 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCBP3Q53F19 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCBP3Q53F19 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCBP3Q53F19 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCBP3Q53F19 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCBP3Q53F19 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCBP3Q53F19 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCBP3Q53F19 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCBP3Q53F19 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCBP3Q53F19 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCBP3Q53F19 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCBP3Q53F19 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCBP3Q53F19 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCBP3Q53F19 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCBP3Q53F19 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCBP3Q53F19 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCBP3Q53F19 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCBP3Q53F19 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCBP3Q53F19 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NCBP3Q53F19 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCBP3Q53F19 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms