Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MSMPQ1L6U9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms