Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN9AQ15858 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN9AQ15858 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
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