Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBE3CQ15386 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3CQ15386 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms