Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KARSQ15046 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KARSQ15046 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KARSQ15046 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KARSQ15046 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KARSQ15046 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KARSQ15046 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KARSQ15046 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KARSQ15046 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KARSQ15046 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KARSQ15046 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KARSQ15046 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KARSQ15046 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KARSQ15046 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KARSQ15046 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KARSQ15046 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KARSQ15046 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KARSQ15046 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KARSQ15046 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KARSQ15046 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KARSQ15046 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KARSQ15046 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KARSQ15046 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KARSQ15046 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KARSQ15046 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KARSQ15046 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KARSQ15046 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KARSQ15046 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KARSQ15046 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KARSQ15046 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KARSQ15046 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KARSQ15046 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KARSQ15046 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KARSQ15046 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KARSQ15046 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KARSQ15046 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KARSQ15046 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KARSQ15046 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KARSQ15046 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KARSQ15046 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KARSQ15046 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KARSQ15046 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KARSQ15046 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KARSQ15046 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KARSQ15046 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KARSQ15046 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KARSQ15046 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KARSQ15046 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KARSQ15046 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KARSQ15046 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KARSQ15046 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KARSQ15046 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KARSQ15046 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KARSQ15046 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KARSQ15046 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KARSQ15046 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KARSQ15046 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KARSQ15046 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KARSQ15046 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KARSQ15046 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KARSQ15046 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KARSQ15046 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KARSQ15046 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KARSQ15046 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KARSQ15046 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KARSQ15046 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KARSQ15046 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KARSQ15046 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KARSQ15046 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KARSQ15046 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KARSQ15046 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KARSQ15046 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KARSQ15046 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KARSQ15046 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KARSQ15046 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KARSQ15046 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KARSQ15046 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KARSQ15046 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KARSQ15046 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KARSQ15046 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KARSQ15046 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KARSQ15046 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KARSQ15046 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KARSQ15046 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KARSQ15046 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KARSQ15046 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KARSQ15046 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KARSQ15046 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KARSQ15046 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KARSQ15046 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KARSQ15046 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KARSQ15046 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KARSQ15046 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KARSQ15046 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KARSQ15046 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KARSQ15046 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KARSQ15046 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KARSQ15046 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KARSQ15046 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KARSQ15046 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
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