Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM2Q15035 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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