Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE3BQ13370 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE3BQ13370 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE3BQ13370 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE3BQ13370 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE3BQ13370 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE3BQ13370 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE3BQ13370 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE3BQ13370 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE3BQ13370 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE3BQ13370 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE3BQ13370 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE3BQ13370 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE3BQ13370 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE3BQ13370 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE3BQ13370 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE3BQ13370 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE3BQ13370 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE3BQ13370 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE3BQ13370 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PDE3BQ13370 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PDE3BQ13370 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PDE3BQ13370 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE3BQ13370 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE3BQ13370 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE3BQ13370 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE3BQ13370 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE3BQ13370 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE3BQ13370 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE3BQ13370 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE3BQ13370 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE3BQ13370 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PDE3BQ13370 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE3BQ13370 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE3BQ13370 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE3BQ13370 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE3BQ13370 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE3BQ13370 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PDE3BQ13370 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE3BQ13370 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE3BQ13370 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE3BQ13370 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE3BQ13370 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE3BQ13370 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE3BQ13370 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE3BQ13370 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE3BQ13370 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE3BQ13370 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE3BQ13370 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE3BQ13370 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE3BQ13370 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PDE3BQ13370 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PDE3BQ13370 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE3BQ13370 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PDE3BQ13370 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PDE3BQ13370 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE3BQ13370 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE3BQ13370 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE3BQ13370 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PDE3BQ13370 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE3BQ13370 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE3BQ13370 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PDE3BQ13370 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE3BQ13370 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE3BQ13370 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE3BQ13370 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE3BQ13370 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE3BQ13370 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE3BQ13370 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE3BQ13370 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE3BQ13370 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE3BQ13370 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE3BQ13370 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE3BQ13370 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE3BQ13370 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE3BQ13370 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE3BQ13370 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE3BQ13370 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PDE3BQ13370 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE3BQ13370 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE3BQ13370 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE3BQ13370 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE3BQ13370 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE3BQ13370 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE3BQ13370 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE3BQ13370 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE3BQ13370 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
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