Protein–RNA interactions for Protein: Q12462

PEX11, Peroxisomal membrane protein PMP27, yeastyeast

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PEX11Q12462 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 PAU2YEL049W 363 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 TDA2YER071C 381 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 VMA7YGR020C 357 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 SMD3YLR147C 306 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 RPL37AYLR185W 267 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 SWS2YNL081C 432 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 YDL073WYDL073W 2955 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 GDS1YOR355W 1569 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 SEC1YDR164C 2175 nt0.73□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.72□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 snR14snR14 160 nt0.72□□□□□ -2.29
PEX11Q12462 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt0.71□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt0.71□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 YMR160WYMR160W 2451 nt0.71□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 RPL42BYHR141C 321 nt0.71□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 RPL16AYIL133C 600 nt0.71□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 HIT1YJR055W 495 nt0.71□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 RPL42AYNL162W 321 nt0.71□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 ATP20YPR020W 348 nt0.71□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 HDA3YPR179C 1968 nt0.7□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 YGR045CYGR045C 363 nt0.7□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 PAU12YGR294W 363 nt0.7□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 QCR9YGR183C 201 nt0.69□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 YOL106WYOL106W 354 nt0.69□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 YBR012CYBR012C 420 nt0.69□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.68□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.68□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.68□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.68□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 YCL020WYCL020W 1317 nt0.68□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 VPS52YDR484W 1926 nt0.68□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 SMB1YER029C 591 nt0.68□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 YAP3YHL009C 993 nt0.68□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt0.68□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 UTP20YBL004W 7482 nt0.68□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 AIM9YER080W 1884 nt0.67□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 CYC7YEL039C 342 nt0.67□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 YER158W-AYER158W-A 216 nt0.67□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 YHR054CYHR054C 1065 nt0.67□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 LIN1YHR156C 1023 nt0.67□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt0.67□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 TOF2YKR010C 2316 nt0.67□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 YCK3YER123W 1575 nt0.66□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.66□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 NOC3YLR002C 1992 nt0.66□□□□□ -2.3
PEX11Q12462 SAG1YJR004C 1953 nt0.65□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 YDL152WYDL152W 366 nt0.65□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.65□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 NBL1YHR199C-A 222 nt0.65□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 URM1YIL008W 300 nt0.65□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 YNL150WYNL150W 408 nt0.65□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 UTP13YLR222C 2454 nt0.65□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 MPT5YGL178W 2580 nt0.65□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.64□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 YLR217WYLR217W 324 nt0.64□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 YBL062WYBL062W 381 nt0.64□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 NUT2YPR168W 474 nt0.64□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 RRI2YOL117W 1938 nt0.64□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 RIM20YOR275C 1986 nt0.63□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.63□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.63□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 YOP1YPR028W 543 nt0.63□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 PIG1YLR273C 1947 nt0.63□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 SET3YKR029C 2256 nt0.63□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 TAD1YGL243W 1203 nt0.62□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 RSM27YGR215W 333 nt0.62□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.62□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.62□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 ZIP1YDR285W 2628 nt0.62□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 ALY2YJL084C 3141 nt0.61□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 snR79snR79 84 nt0.61□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 YGL109WYGL109W 324 nt0.61□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 TIM10YHR005C-A 282 nt0.61□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 YOR199WYOR199W 330 nt0.61□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.61□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 YPR170CYPR170C 336 nt0.61□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 YDL206WYDL206W 2289 nt0.59□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.59□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 COX7YMR256C 183 nt0.59□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 YPL197CYPL197C 414 nt0.59□□□□□ -2.31
PEX11Q12462 SWI6YLR182W 2412 nt0.59□□□□□ -2.32
PEX11Q12462 SWI5YDR146C 2130 nt0.59□□□□□ -2.32
PEX11Q12462 AIM44YPL158C 2277 nt0.58□□□□□ -2.32
PEX11Q12462 MXR1YER042W 555 nt0.58□□□□□ -2.32
PEX11Q12462 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt0.58□□□□□ -2.32
PEX11Q12462 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.58□□□□□ -2.32
PEX11Q12462 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.58□□□□□ -2.32
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