Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 ATP7YKL016C 525 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 YCL046WYCL046W 324 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 YDR186CYDR186C 2634 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 PRP6YBR055C 2700 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 SET1YHR119W 3243 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 RCY1YJL204C 2523 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 YIL174WYIL174W 228 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 RPS8AYBL072C 603 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 SBE22YHR103W 2559 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 TAE2YPL009C 3117 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 YHR080CYHR080C 4038 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 PTP3YER075C 2787 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 RRM3YHR031C 2172 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 YJL120WYJL120W 324 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 SQS1YNL224C 2304 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 MNE1YOR350C 1992 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 PIP2YOR363C 2991 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 SMC2YFR031C 3513 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 SOM1YEL059C-A 225 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 HRD3YLR207W 2502 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 FUN30YAL019W 3396 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 CRM1YGR218W 3255 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 RPA135YPR010C 3612 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 MGR2YPL098C 342 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 YKU80YMR106C 1890 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 URA2YJL130C 6645 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 YIL080WYIL080W 4722 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 PUT3YKL015W 2940 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 RRP5YMR229C 5190 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 PAU3YCR104W 375 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 RPL20AYMR242C 519 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 ENA5YDR038C 3276 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 ENA2YDR039C 3276 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 ENA1YDR040C 3276 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1A-DR3Q12441 MAK21YDR060W 3078 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 CSR2YPR030W 3366 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 LYS14YDR034C 2373 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 AFI1YOR129C 2682 nt3.01□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 RPL31AYDL075W 342 nt3.01□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 YBR225WYBR225W 2703 nt3□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 SAF1YBR280C 1914 nt3□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 YNL144CYNL144C 2223 nt3□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 NOC3YLR002C 1992 nt3□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 RDS1YCR106W 2499 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 SMY2YBR172C 2223 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 STF2YGR008C 255 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 CDC31YOR257W 486 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 ZRG8YER033C 3231 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 POL2YNL262W 6669 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 APL5YPL195W 2799 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 RSF2YJR127C 4143 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 SLD3YGL113W 2007 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 FRE2YKL220C 2136 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 CHS2YBR038W 2892 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 RPL33AYPL143W 324 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 LOS1YKL205W 3303 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 SLM1YIL105C 2061 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 TCB3YML072C 4638 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 snR45snR45 172 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 YDR239CYDR239C 2364 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 YOR019WYOR019W 2193 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 IRR1YIL026C 3453 nt2.96□□□□□ -1.93
TY1A-DR3Q12441 YDL118WYDL118W 381 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 PSK1YAL017W 4071 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 HOS4YIL112W 3252 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 TFC1YBR123C 1950 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 NET1YJL076W 3570 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 VPS16YPL045W 2397 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 RRP6YOR001W 2202 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 DSE4YNR067C 3354 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 RGA2YDR379W 3030 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 ZIP2YGL249W 2115 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 TAF2YCR042C 4224 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 SPO71YDR104C 3738 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 AUS1YOR011W 4185 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 RAD34YDR314C 2079 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 FRT2YAL028W 1587 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 GCN1YGL195W 8019 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 STB4YMR019W 2850 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 STU2YLR045C 2667 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 GCV2YMR189W 3105 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 SAS3YBL052C 2496 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 YDL242WYDL242W 354 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 TAO3YIL129C 7131 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 PRP5YBR237W 2550 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 CHS6YJL099W 2241 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 SET2YJL168C 2202 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1A-DR3Q12441 SNC1YAL030W 354 nt2.91□□□□□ -1.94
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