Protein–RNA interactions for Protein: Q08969

GRE1, Protein GRE1, yeastyeast

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GRE1Q08969 CUP1-1YHR053C 186 nt0.72□□□□□ -2.29
GRE1Q08969 CUP1-2YHR055C 186 nt0.72□□□□□ -2.29
GRE1Q08969 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.72□□□□□ -2.29
GRE1Q08969 TMA22YJR014W 597 nt0.72□□□□□ -2.29
GRE1Q08969 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt0.72□□□□□ -2.29
GRE1Q08969 IRC23YOR044W 474 nt0.72□□□□□ -2.29
GRE1Q08969 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.72□□□□□ -2.29
GRE1Q08969 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.72□□□□□ -2.29
GRE1Q08969 GEA2YEL022W 4380 nt0.72□□□□□ -2.29
GRE1Q08969 LTE1YAL024C 4308 nt0.72□□□□□ -2.29
GRE1Q08969 YDR521WYDR521W 336 nt0.71□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.71□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 TAD1YGL243W 1203 nt0.71□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 ACF4YJR083C 930 nt0.71□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 SWT1YOR166C 1377 nt0.7□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 YDR115WYDR115W 318 nt0.7□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 LIN1YHR156C 1023 nt0.7□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 RRI2YOL117W 1938 nt0.7□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 PXA2YKL188C 2562 nt0.69□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 NHP2YDL208W 471 nt0.69□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.69□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 DDR48YMR173W 1293 nt0.69□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 ATP20YPR020W 348 nt0.69□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 AIM9YER080W 1884 nt0.69□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 YDL073WYDL073W 2955 nt0.68□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 SEC1YDR164C 2175 nt0.68□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 CYC7YEL039C 342 nt0.68□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.68□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.68□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.68□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.68□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.68□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.68□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.68□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.68□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.68□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.68□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.68□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 INA22YIR024C 651 nt0.68□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 PAU18YLL064C 363 nt0.68□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 CMC4YMR194C-B 222 nt0.68□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 YNL150WYNL150W 408 nt0.68□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 PAU6YNR076W 363 nt0.68□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 YCL046WYCL046W 324 nt0.68□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 YMR160WYMR160W 2451 nt0.66□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 YDL206WYDL206W 2289 nt0.66□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 RSM27YGR215W 333 nt0.66□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.66□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 PRP16YKR086W 3216 nt0.66□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 RKR1YMR247C 4689 nt0.65□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 OST1YJL002C 1431 nt0.65□□□□□ -2.3
GRE1Q08969 GPM2YDL021W 936 nt0.65□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.65□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 PIG1YLR273C 1947 nt0.65□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 PAC1YOR269W 1485 nt0.65□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 SWI5YDR146C 2130 nt0.65□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 YLL007CYLL007C 1998 nt0.65□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 VPS52YDR484W 1926 nt0.64□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 YDR114CYDR114C 303 nt0.64□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.64□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.64□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 YOR199WYOR199W 330 nt0.64□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 YDL152WYDL152W 366 nt0.63□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt0.63□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 SLX9YGR081C 633 nt0.63□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 YLR217WYLR217W 324 nt0.63□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 ALY2YJL084C 3141 nt0.62□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 PDE2YOR360C 1581 nt0.62□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 MMS4YBR098W 2076 nt0.62□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 TIM10YHR005C-A 282 nt0.62□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt0.62□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 YKL111CYKL111C 336 nt0.62□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 YPL197CYPL197C 414 nt0.62□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 YOP1YPR028W 543 nt0.62□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 SLM6YBR266C 453 nt0.62□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 BI4Q0120 1917 nt0.62□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 snR79snR79 84 nt0.61□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 CMC1YKL137W 336 nt0.61□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 YPT6YLR262C 648 nt0.61□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 YBR071WYBR071W 636 nt0.61□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.61□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 YJR003CYJR003C 1560 nt0.61□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.6□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 SET3YKR029C 2256 nt0.6□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 MYO1YHR023W 5787 nt0.6□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 YDR509WYDR509W 348 nt0.59□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 MXR1YER042W 555 nt0.59□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.59□□□□□ -2.31
GRE1Q08969 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.58□□□□□ -2.32
GRE1Q08969 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.58□□□□□ -2.32
GRE1Q08969 YBR032WYBR032W 303 nt0.58□□□□□ -2.32
GRE1Q08969 SCW11YGL028C 1629 nt0.57□□□□□ -2.32
GRE1Q08969 ULP2YIL031W 3105 nt0.57□□□□□ -2.32
GRE1Q08969 YER158W-AYER158W-A 216 nt0.57□□□□□ -2.32
GRE1Q08969 ALG13YGL047W 609 nt0.57□□□□□ -2.32
GRE1Q08969 SDH2YLL041C 801 nt0.57□□□□□ -2.32
GRE1Q08969 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt0.57□□□□□ -2.32
GRE1Q08969 FMP27YLR454W 7887 nt0.56□□□□□ -2.32
GRE1Q08969 MKT1YNL085W 2493 nt0.56□□□□□ -2.32
GRE1Q08969 FIG4YNL325C 2640 nt0.55□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 65.6 ms