Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTDSPL2Q05D32 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms