Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms