Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE1P56817 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE1P56817 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE1P56817 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE1P56817 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE1P56817 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BACE1P56817 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE1P56817 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE1P56817 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE1P56817 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE1P56817 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE1P56817 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE1P56817 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE1P56817 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE1P56817 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE1P56817 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE1P56817 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE1P56817 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE1P56817 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE1P56817 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE1P56817 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE1P56817 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE1P56817 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE1P56817 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE1P56817 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE1P56817 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BACE1P56817 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE1P56817 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE1P56817 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE1P56817 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE1P56817 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE1P56817 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE1P56817 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE1P56817 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE1P56817 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE1P56817 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE1P56817 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE1P56817 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE1P56817 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE1P56817 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE1P56817 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE1P56817 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BACE1P56817 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
BACE1P56817 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BACE1P56817 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE1P56817 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE1P56817 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE1P56817 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE1P56817 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE1P56817 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE1P56817 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE1P56817 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE1P56817 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE1P56817 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE1P56817 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE1P56817 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE1P56817 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE1P56817 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE1P56817 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE1P56817 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BACE1P56817 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BACE1P56817 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BACE1P56817 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BACE1P56817 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BACE1P56817 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BACE1P56817 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BACE1P56817 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BACE1P56817 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BACE1P56817 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BACE1P56817 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BACE1P56817 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BACE1P56817 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BACE1P56817 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BACE1P56817 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BACE1P56817 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BACE1P56817 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BACE1P56817 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE1P56817 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE1P56817 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE1P56817 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE1P56817 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE1P56817 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE1P56817 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE1P56817 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE1P56817 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE1P56817 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE1P56817 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE1P56817 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE1P56817 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE1P56817 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE1P56817 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BACE1P56817 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE1P56817 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE1P56817 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE1P56817 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE1P56817 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE1P56817 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE1P56817 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE1P56817 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BACE1P56817 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms