Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAPAP54920 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAPAP54920 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAPAP54920 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NAPAP54920 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAPAP54920 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAPAP54920 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAPAP54920 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAPAP54920 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAPAP54920 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAPAP54920 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAPAP54920 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAPAP54920 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAPAP54920 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAPAP54920 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAPAP54920 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAPAP54920 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAPAP54920 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAPAP54920 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAPAP54920 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAPAP54920 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAPAP54920 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAPAP54920 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAPAP54920 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAPAP54920 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAPAP54920 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAPAP54920 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAPAP54920 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAPAP54920 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAPAP54920 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAPAP54920 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAPAP54920 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAPAP54920 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NAPAP54920 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAPAP54920 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAPAP54920 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAPAP54920 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAPAP54920 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NAPAP54920 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAPAP54920 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAPAP54920 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAPAP54920 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAPAP54920 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAPAP54920 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAPAP54920 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NAPAP54920 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAPAP54920 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAPAP54920 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAPAP54920 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAPAP54920 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAPAP54920 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAPAP54920 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAPAP54920 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAPAP54920 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAPAP54920 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAPAP54920 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAPAP54920 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAPAP54920 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAPAP54920 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAPAP54920 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAPAP54920 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NAPAP54920 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAPAP54920 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAPAP54920 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAPAP54920 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAPAP54920 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAPAP54920 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAPAP54920 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAPAP54920 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAPAP54920 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAPAP54920 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAPAP54920 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAPAP54920 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NAPAP54920 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAPAP54920 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAPAP54920 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAPAP54920 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAPAP54920 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAPAP54920 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAPAP54920 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAPAP54920 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAPAP54920 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NAPAP54920 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAPAP54920 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAPAP54920 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAPAP54920 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAPAP54920 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAPAP54920 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAPAP54920 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAPAP54920 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAPAP54920 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAPAP54920 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAPAP54920 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAPAP54920 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAPAP54920 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NAPAP54920 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAPAP54920 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAPAP54920 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAPAP54920 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAPAP54920 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms