Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E1P51965 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms