Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFTPDP35247 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms