Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKARP32238 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCKARP32238 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCKARP32238 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCKARP32238 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCKARP32238 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCKARP32238 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCKARP32238 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCKARP32238 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCKARP32238 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCKARP32238 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCKARP32238 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCKARP32238 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCKARP32238 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCKARP32238 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCKARP32238 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCKARP32238 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCKARP32238 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCKARP32238 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCKARP32238 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCKARP32238 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCKARP32238 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCKARP32238 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCKARP32238 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCKARP32238 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCKARP32238 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCKARP32238 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCKARP32238 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCKARP32238 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCKARP32238 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCKARP32238 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCKARP32238 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCKARP32238 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCKARP32238 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCKARP32238 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCKARP32238 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCKARP32238 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCKARP32238 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCKARP32238 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCKARP32238 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCKARP32238 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCKARP32238 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCKARP32238 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCKARP32238 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCKARP32238 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms