Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM13AO94988 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms