Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRNO43815 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRNO43815 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRNO43815 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRNO43815 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRNO43815 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRNO43815 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRNO43815 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRNO43815 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRNO43815 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRNO43815 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRNO43815 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRNO43815 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRNO43815 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRNO43815 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRNO43815 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRNO43815 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRNO43815 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRNO43815 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRNO43815 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRNO43815 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRNO43815 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRNO43815 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRNO43815 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRNO43815 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
STRNO43815 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRNO43815 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRNO43815 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRNO43815 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRNO43815 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STRNO43815 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRNO43815 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRNO43815 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRNO43815 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STRNO43815 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23■■□□□ 1.27
STRNO43815 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRNO43815 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STRNO43815 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
STRNO43815 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STRNO43815 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STRNO43815 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
STRNO43815 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23■■□□□ 1.27
STRNO43815 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRNO43815 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRNO43815 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRNO43815 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRNO43815 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRNO43815 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRNO43815 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STRNO43815 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRNO43815 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRNO43815 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRNO43815 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRNO43815 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRNO43815 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRNO43815 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRNO43815 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRNO43815 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRNO43815 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRNO43815 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
STRNO43815 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRNO43815 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRNO43815 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRNO43815 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRNO43815 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRNO43815 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRNO43815 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRNO43815 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
STRNO43815 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRNO43815 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRNO43815 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRNO43815 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
STRNO43815 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRNO43815 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRNO43815 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRNO43815 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
STRNO43815 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRNO43815 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRNO43815 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRNO43815 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRNO43815 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRNO43815 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRNO43815 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRNO43815 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRNO43815 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRNO43815 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRNO43815 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRNO43815 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRNO43815 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRNO43815 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRNO43815 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRNO43815 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRNO43815 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRNO43815 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRNO43815 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRNO43815 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRNO43815 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRNO43815 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRNO43815 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRNO43815 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms