Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRIN2DO15399 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIN2DO15399 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms